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第二军医大学南京军医学院航空潜水医学教研室的前身“海军军医学校潜水医学教研室”组建于1976年。本教研室是海军军事医学特色科室，是国内唯一在同一科室开展海军潜水医学和海军航空医学教学、科研的教研室。现教研室拥有工作人员6名。教研室成立至今获军队科技进步二等奖2项，三等奖5项，每年平均发表论文5篇。