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香蕉Aux/IAA基因家族的全基因组鉴定及表达分析
香蕉 Aux/IAA基因家族 生物信息学 基因表达
2019/11/5
对香蕉Aux/IAA基因家族进行了全基因组鉴定，获得分布于除1号染色体外的10条染色体上的44个家族成员，其CDS长度为378 ~ 1 062 bp，其中10个存在选择性剪切体。它们编码的蛋白包含125 ~ 353个氨基酸，均为不含信号肽的亲水蛋白。序列分析结果表明：该基因家族成员多为5个外显子和4个内含子的基因结构，编码蛋白多具有4个典型的保守基序。亚细胞定位预测结果显示，Aux/IAA成员多定...
桃果实中miR160a与其靶基因ARF的鉴定及对IAA的响应分析
桃 Ppe-miR160a 靶基因 ARF 生长素
2019/6/5
以水蜜桃品种‘小白凤’果实为试材，利用miR-RACE技术验证了桃miR160a的精确序列，克隆了其3个ARF靶基因（PpARF18、PpARF17和PpARF18-like）的ORF序列。利用RLM-RACE技术以及qRT-PCR方法对Ppe-miR160a作用于3个靶基因的模式及频度进行了分析。结果表明，Ppe-miR160a的精确序列与预测序列在5′端和3′端均存在1个碱基的差异，其3个靶基...
桃Aux/IAA家族基因鉴定及在果实成熟过程中的表达分析
桃 生长素/吲哚乙酸基因 果实成熟 生长素
2018/4/9
通过生物信息学鉴定桃基因组中生长素/吲哚乙酸（Aux/IAA）基因家族，并对其在溶质型和硬质型桃果实成熟阶段的表达水平进行qRT-PCR检测。结果表明：桃Aux/IAA基因家族包含22个成员，这些基因集中分布在5条染色体上，以第1条染色体上含有最多，为8个。大部分Aux/IAA基因包含高度保守的Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ功能域，聚类分析表明其分为10类。基因结构分析显示这些基因包含2 ~ 5个外显子。荧光定量...