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本发明涉及一种棕色棉纤维色泽主效QTL连锁的SSR分子标记及用途，属于植物分子遗传学和彩色棉种质技术领域，本发明所提供的棕色纤维色泽主效QTL的分子标记的两个引物，标记NAU5235和标记NAU3496进行PCR扩增，检测扩增产物中有270bp片段和310bp片段。通过已知的染色体进行锚定，将主效QTL位点定位在第15号染色体上。同时，本发明的两个分子标记皆可用于检测其纤维色泽或者其后代的纤维色泽...
中国林业科学研究院热林所在速生桉QTL定位研究中取得进展（图）
QTL定位 材林树种 分子遗传
2023/3/19
木材资源短缺已经成为国际社会公认的发展障碍问题之一，我国森林覆盖率低于全球平均水平，可利用木材资源少。桉树(Eucalyptus)是我国重要的人工林用材树种，尾叶桉(E. urophylla)、细叶桉(E. tereticornis)及其杂交种是华南地区重要的短周期用材林树种(尤其是用于纸浆工业用材林营建)，也是较好的林木分子遗传研究材料。高密度遗传图谱构建及重要经济性状(生长与材性)的QTL定位...
Salinity Tolerance and Na Exclusion in Wheat: Variability, Genetics, Mapping Populations and QTL Analysis
genetics mapping populations Na + exclusion QTL analysis salinity tolerance variability
2014/2/25
A wide range of variability in both Naexclusion and salinity tolerance was shown in Triticum dicoccoides and the best performing genotype, from Getit, was identified for further study andfor crossing....
株高是典型的数量性状, 易受遗传背景的干扰和环境因素的影响, 利用单片段代换系(single segment substitution lines, SSSLs)能减少遗传背景的干扰。以85个单片段代换系为材料, 其受体亲本为籼稻广陆矮4号(Oryza sativa ssp. indica), 供体亲本为粳稻日本晴(Oryza sativa ssp. japonica)。通过单因素方差分析和Dun...
关联图分析: 一种基于连锁图的QTL综合分析方法
连锁图 数量性状基因座 统合分析 关联图分析
2013/9/6
通过统合分析整合多个独立实验QTL (quantitative trait locus)定位结果获得的一致性QTL, 可为标记辅助育种和基因图位克隆提供坚实基础. 但是这种方法没有充足的生物学背景支撑, 而且遗传图谱间不同映射会严重影响分析结果. 为此, 本文提出一种基于连锁图的QTL综合分析法, 简称关联图分析. 首先, 利用连锁群构建图模型; 然后, 利用非监督分类法来寻找基因组间具有模式性共...
摘要用可溶性固形物含量高、薄皮、感枯萎病的栽培西瓜自交系(Citrullus lanatus var.lanatus)97103和可溶性固形物含量低、皮厚、抗病的野生西瓜种质(Citrullus lanatus var.citroides)PI296341杂交所得F~2|的118个单株为作图群体,通过构建分子连锁图谱,对西瓜主要果实性状可溶性固形物含量、果皮硬度、果皮厚度、单果重、种子千粒重进行区...
孙女设计中标记密度对QTL定位精确性的影响
标记密度 QTL定位 最小二乘法 孙女设计
2008/2/5
摘要采用蒙特卡罗方法分析了在孙女设计中不同的群体结构、性状遗传力、Q TL效应大小和QTL在染色体上的位置等各个因素不同水平组合下4种标记密度(标记间隔5cM,10cM,20cM和50cM)对QTL定位精确性(以均方误MSE为衡量指标)的影响,并从经济学角度探讨了应用于标记辅助选择(MAS)的QT L定位的最佳标记密度。结果表明,一般说来,在各因素水平都较低时,MSE随标记密度加大而下降的相对幅度...
性状遗传力与QTL方差对标记辅助选择效果的影响
marker-assisted selection trait heritability QTL variance stochastic simulation
2008/1/31
摘要 在采用动物模型标记辅助最佳线性无偏预测方法对个体育种值进行估计的基础上，模拟了在一个闭锁群体内连续对单个性状选择10个世代的情形，并系统地比较了性状遗传力和QTL方差对标记辅助选择所获得的遗传进展、QTL增效基因频率和群体近交系数变化的影响。结果表明：在对高遗传力和QTL方差较小的性状实施标记辅助选择时，可望获得更大的遗传进展；遗传力越高，QTL方差越大，则QTL增效基因频率的上升速度越快；...
离散性状QTL区间定位的最大似然方法
离散性状 阈模型 QTL定位 最大似然法
2008/1/30
摘要采用最大似然区间定位法对阈模型与一般线性模型的QTL定位效率进行了比较，并对影响离散性状QTL检测效率的主要因素（QTL效应、性状的遗传力和表型发生率）进行了模拟研究，试验设计为多个家系的女儿设计，资源群体大小为500头。研究结果表明：在QTL参数估计及检验功效方面，阈模型方法具有较大的优势，对离散性状QTL定位的效率明显高于LM(Linear Model)方法，定位的准确性也较高。另外，性状...
猪2号染色体遗传连锁图谱的构建与QTL定位分析
猪 微卫星 遗传连锁图谱 QTL
2008/1/29
摘要构建了猪2号染色体的遗传连锁图谱,并进一步进行了重要生产性状数量性状位点的定位.结果表明,7个微卫星位点均为中高度多态性位点,多态信息含量为0.40182～0.58477,可以满足遗传连锁图谱构建的要求.构建的资源家系遗传连锁图谱总长152.9cM,位点的排列顺序与USDA结果一致,但除了Sw2516与Sw1201标记区间外,所有标记区间距离均大于USDA图谱.将连锁图谱与性状记录结合起来,进...
人类复杂遗传疾病QTL分析方法的理论探讨
复杂遗传病 连锁不平衡 基因定位 QTL分析
2008/1/29
摘要利用连锁不平衡理论,人类遗传学家已能把影响人类疾病的质量基因定位在小至1cM区域内,有些基因已被克隆出来。罗泽伟等进一步发展统计分析方法检测及估算分子标记与QTL之间的连锁不平衡系数,从而提出了人类复杂遗传病高解析度基因定位的理论策略。以此为基础,进一步探讨了供试群体在双亲基因频率存在差异时检测QTL和检测QTL互作的方法,给出了有关的理论结果。
水稻株高上位性效应和QE互作效应的QTL遗传研究
数量性状位点 上位性效应 环境互作效应 水稻株高
2008/1/26
摘要利用基于混合模型的QTL定位方法研究了由籼稻品种IR64和粳稻品种Azucena杂交衍生的DH群体在4个环境中的QTL上位性效应和环境互作效应。结果表明，上位性是数量性状的重要遗传基础，并揭示了上位性的几个重要特点。所有的QTL都参与了上位性效应的形成，64%的QTL还具有本身的加性效应。因此传统方法对QTL加性效应的估算会由于上位性的影响而有偏。其他36%的QTL没有本身的加性效应，却参与了...
贝叶斯统计在QTL作图中的应用研究进展
贝叶斯统计 QTL作图 进展
2008/1/24
摘要在许多复杂情况下, 贝叶斯统计方法比经典数理统计方法能更直接解决问题, 且可有效整合部分先验信息, 但其需要高强度计算的特性曾限制了其广泛应用。近几十年来, 随着高速计算机的发展以及MCMC算法的不断提出, 贝叶斯方法已被用于群体遗传学、分子进化、连锁作图和数量遗传学等研究领域, 文章综述了数量遗传学中QTL作图的贝叶斯方法从简单到复杂的发展历程。
基于F3种子的胚乳性状QTL区间定位
胚乳 QTL作图 母体效应 两步等级设计
2008/1/24
摘要文章提出了包括胚乳效应和母体效应的胚乳性状QTL定位的统计方法，该方法的实验设计是分子标记基因型信息来自F2母体植株和F3种子胚（或植株），胚乳性状表型值来自F3单粒种子胚乳，称之为两步等级设计。同时，用计算机全面模拟以验证该模型的可行性，模拟结果表明，只要群体足够大，该模型能较有效地进行胚乳性状QTL定位并精确地估计出胚乳QTL的各种遗传效应和母体效应。
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多QTL定位的压缩估计方法
Bayesian分析 上位性 多QTL模型 数量性状基因座 压缩估计
2008/1/23
本文综述了多标记分析和多QTL定位的压缩估计方法。对于前者，Xu (Genetics, 2003, 163:789-801)首先提出了Bayesian压缩估计方法。其关键在于让每个效应有一个特定的方差参数，而该方差又服从一定的先验分布，以致能从资料中估计之。由此，能够同时估计大量分子标记基因座的遗传效应，即使大多数标记的效应是可忽略的。然而，对于上位性遗传模型，其运算时间还是过长。为此，笔者将上述...