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中国科学院南海海洋研究所科研人员建立原噬菌体de novo预测新算法(图)
原噬菌体 de novo预测
2022/10/20
中国科学院南海海洋研究所研究员王晓雪团队建立了一种不依赖于噬菌体基因序列相似性的原噬菌体de novo预测新算法,集成分析流程的工具名为Prophage Tracer。相关研究2021年9月22日在线发表于《核酸研究》。汤开浩博士为论文第一作者,王晓雪为通讯作者。来自天津生物芯片技术有限责任公司的孙亚民博士也参与基因组分析工作。
【目的】通过RNA seq技术对纯培养的蜜蜂球囊菌Ascosphaera apis孢子和球囊菌侵染的蜜蜂幼虫肠道组织进行测序,de novo组装球囊菌的参考转录组,并对其进行功能与代谢通路注释,进而基于该转录组数据开发球囊菌的SSR分子标记。【方法】首先通过差速离心获得活化的球囊菌孢子,配制含1×107孢子/mL的饲料饲喂4,5和6日龄的意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica幼...
De novo genome assembly of the blow fly Phormia regina (Diptera: Calliphoridae)
De novo assembly Genome Calliphoridae Phormia regina Blow fly Next Generation Sequencing
2015/5/22
Phormia regina (Meigen), commonly known as the black blow fly is a dipteran that belongs to the family Calliphoridae. Calliphorids play an important role in various research fields including ecology, ...
复杂染色体重排的女性携带者与她健康的女儿A de novo Complex Chromosomal RearrangementIncluding Translocation on 1,5 and 12 in a Female Carrier with her Healthy Girl
复杂染色体易位 女性携带者 健康女儿
2008/1/8
摘要
一例新生复杂染色体重排的女性携带者(complex chromosome rearrangement ,CCR),易位涉及1号、5号和12号染色体。病人因2次自然流产而要求进行外周血淋巴细胞G显带核型分析。最初G显带核型疑为46,XX,t(1;5;12)(1pter→1q25::12q24→12qter;5qter→5p11::1q25→1qter;12pter→12q24::5p11→...