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利用猪1.4M高密度SNP芯片检测巴马香猪全基因组拷贝数变异
巴马香猪 拷贝数变异 1.4M高密度SNP芯片
2021/3/11
旨在检测巴马香猪基因组上的拷贝数变异（CNV），并探究标记密度对于CNV检测效率和准确率的影响。本研究利用319头巴马香猪（其中阉公猪160头和母猪159头）1.4M高密度SNP芯片的数据，采用PennCNV和R-Gada两种软件进行CNVs检测；然后通过重叠CNV融合法，构建拷贝数变异区域（CNVR），并用全基因组关联分析（GWAS）对频率大于5%的CNVR进行验证；最后根据不同的标记密度，均匀...
江苏部分地区鸡源与猪源弯曲菌耐药性分析与毒力基因检测
弯曲菌 耐药性 毒力基因 分离鉴定
2021/3/12
旨在了解江苏省部分地区鸡源与猪源弯曲菌的耐药及毒力基因携带情况。从江苏省25个规模养殖场采集250份粪便样品进行弯曲菌的分离鉴定，采用琼脂平板稀释法测定9种抗菌药物的最小抑菌浓度（minimal inhibitory concentrations，MICs），PCR方法扩增弯曲菌8种与致病力相关的毒力基因。结果显示：共分离得到93株弯曲菌，包括空肠弯曲菌45株，结肠弯曲菌48株；空肠弯曲菌对萘啶酸...
【目的】 研究新疆羊源STEC的耐药性和毒力情况,评价羊源STEC在羊产业链饲养阶段的风险。【方法】 从某规模化羊场随机采取2月龄羊的肛拭子样本,EC肉汤增菌后用MAC平板结合双重PCR(stx1,stx2)法分离鉴定STEC,用SMAC平板结合双重PCR(rfbE和fliC)法分离鉴定E. coli O157:H7;用K-B法做9类18种药的敏感试验,并用PCR检测相应的耐药基因;用PCR检测S...
本研究旨在检测重组结核分枝杆菌10 ku培养滤液蛋白（culture filtrate protein 10，CFP10）对肺泡Ⅱ型上皮细胞系A549细胞Toll样受体（TLRs）信号途径及其介导的炎症反应的影响。PCR扩增cfp10目的基因片段，构建重组质粒载体pCzn1-CFP10。将重组质粒pCzn1-CFP10转入BL21（DE3）大肠杆菌感受态细胞，IPTG诱导表达重组蛋白CFP10（r...
为阐明KLF5在山羊不同组织和不同诱导分化阶段的肌内脂肪细胞中的表达特性，利用降落PCR克隆山羊KLF5基因cDNA序列，通过各种在线工具分析山羊KLF5基因的生物学特征，利用实时荧光定量PCR技术分析KLF5基因在山羊不同组织和不同诱导分化阶段的肌内脂肪细胞中的表达水平。结果表明，克隆获得山羊KLF5基因序列1 735 bp，其中包括1 365 bp完整的开放阅读框（ORF）、8 bp的5'非翻...
旨在预测并验证调控小眼畸形相关转录因子（microphthalmia-associated transcription factor， MITF）基因表达的关键miRNA。使用在线软件对与MITF具有靶向关系的miRNAs进行预测。在羊驼黑色素细胞中，利用荧光定量PCR检测过表达和抑制表达miR-96-5p后MITF基因的表达量；通过免疫细胞化学技术对过表达和抑制表达miR-96-5p的细胞进行M...
旨在通过克隆牦牛MDH Ⅱ 基因，探究其组织表达谱及与脂代谢候选基因的相关性，为进一步研究牦牛脂代谢机制提供基础数据。采集0.5，2.5，3.5，7.5岁4个年龄段的12头牦牛心脏、肝脏、肺脏、臀肌和臀脂组织总RNA并反转录成cDNA，实时荧光定量检测MDH Ⅱ 表达量；随机选取12个与脂代谢相关的候选基因，采用实时荧光定量检测MDH Ⅱ 在类乌齐牦牛臀肌、臀脂上的表达量，利用皮尔森系数法计算其与...
为探明藏黄牛对低氧适应的相关差异表达基因并分析差异表达基因功能和代谢通路，以藏黄牛和三江黄牛心脏组织为研究对象，提取总RNA，建立测序文库后利用Illumina HiSeqTM 4000进行测序，经生物信息学分析筛选出差异表达转录本，并对差异表达基因进行GO富集和KEGG通路分析，最后采用荧光定量PCR（RT-qPCR）验证测序数据的准确性。结果表明：藏黄牛相比于三江黄牛得到显著差异表达基因608...
旨在研究miR-128-1-5p对绵羊前体脂肪细胞增殖与分化的调节作用。本研究经理论预测和试验研究验证miR-128-1-5p的靶基因；过表达miR-128-1-5p后，用qPCR检测增殖标志基因的表达，CCK-8和EdU检测细胞增殖情况；用qPCR和Western blotting检测miR-128-1-5p和其靶基因在前体脂肪细胞分化中的表达趋势；通过过表达或抑制miR-128-1-5p研究其...
牦牛肌钙蛋白I基因家族的克隆及组织表达分析
牦牛 肌钙蛋白I基因家族 克隆 组织表达
2021/4/12
为了克隆TNNI基因家族，预测其蛋白结构和功能，并分析其在牦牛不同组织中的表达差异，以0.5岁健康的类乌齐牦牛为试验材料，采用RT-PCR技术克隆牦牛肌钙蛋白I基因家族的CDS区序列并进行生物信息学分析，利用实时荧光定量PCR技术检测TNNI基因家族各成员的mRNA表达水平。结果表明，TNNI1、TNNI2和TNNI3基因CDS区大小分别为564，549，639 bp，分别编码187，182，21...
影响山羊肉质的指标很多，其中肌内脂肪（IMF）、肌肉嫩度、肌苷酸（IMP）是业界公认的部分主要指标。本文对IMF、肌肉嫩度、IMP的相关主效基因脂肪型脂肪酸结合蛋白（A-FABP）、心脏型脂肪酸结合蛋白（H-FABP）、腺苷酸琥珀酸裂解酶（ADSL）、钙蛋白酶1（CAPN1）及钙蛋白酶抑制蛋白（CAST）基因近年来的研究进展情况进行综述，以期为开展山羊肉质相关主效基因的研究及肉用性状选育提供一定的...
鸽乳是由鸽嗉囊组织生成并分泌的半固态营养物质，是乳鸽唯一的营养来源。乳鸽出生后不能自主觅食，需由亲鸽哺育，鸽乳对其生长发育极为重要。鸽乳的生成及分泌是一种特殊的生理过程，在禽类中极为少见，也不同于哺乳动物的泌乳过程。鸽乳主要由蛋白质、脂质、碳水化合物和矿物质等物质组成，其合成与分泌受催乳素、胰岛素和松弛素等多种激素共同调控，通过激活JAK/STAT、PI3K/Akt/TOR、AMPK和Wnt等信号...
鸡血糖性状的全基因组关联分析
血糖 鸡 全基因组重测序 SNP 全基因组关联分析(GWAS) 分子标记
2020/7/9
旨在挖掘影响鸡血糖性状的有效SNP位点及功能基因，为优质肉鸡分子育种工作提供有效的理论支撑。本试验选取407只京星黄母鸡于98日龄屠宰，酚仿法提取血液DNA，进行深度为10×的全基因组重测序；葡萄糖氧化酶法测定血清中血糖水平，基于全基因组重测序和血糖表型数据进行全基因组关联分析（GWAS）。结果，GWAS共筛选到6个血糖相关的SNPs位点（关联阈值P < 1.43×10-6）。基因注释发现，rs7...
旨在克隆乌蒙凤鸡醌型二氢生物喋呤还原酶（quinoid dihydropteridine reductase，QDPR）基因，并检测其在不同性别乌蒙凤鸡不同生长阶段各组织中的表达差异，以研究QDPR基因在乌蒙凤鸡生长发育过程中的调控作用。本试验对乌蒙凤鸡QDPR基因CDS区进行PCR扩增和克隆，并对得到的序列进行生物信息学分析，通过实时荧光定量PCR检测QDPR基因在4、12、20和28周龄乌蒙凤...
旨在明确miR-106b-5p对山羊肌内前体脂肪细胞分化的影响，并确定这种作用是通过靶向KLF4来实现的。本研究利用实时荧光定量PCR （quantitative real-time PCR，qRT-PCR）技术检测miR-106b-5p在山羊肌内前体脂肪细胞分化过程中的表达模式，通过脂质体转染技术将miR-106b-5p mimic和miR-106b-5p inhibitor转入体外培养的山羊肌...