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非洲猪瘟病毒(ASFV)基因组约有20%的基因编码蛋白参与病毒mRNA的转录和修饰。这种独特的转录机制使ASFV能够在宿主细胞内独立进行基因表达的精确调控。由于缺乏天然RNA聚合酶复合物机器的结构学信息,ASFV转录的具体生物过程、组装和调控机制尚不清楚。
中国科学院海洋研究所陈楠生课题组通过对骨条藻物种单株系开展基于核糖体基因18S rDNA V4区的宏条形码分析,发现每个骨条藻单株系内存在大量18S rDNA V4扩增子序列变异(amplicon sequence variants,ASVs),表明其基因组内存在较高水平的rDNA基因组内变异(intra-genomic variation,IGV)。这项成果近期发表在学术期刊Environmen...
树鼩是一种广泛分布于中国和东南亚的小型哺乳动物,因其高脑重比,被认为是最接近灵长类动物的哺乳动物,适于作为新的模式物种在神经科学领域进行研究。表观调控关键因素DNA甲基化在基因表达、X染色体失活等调控过程中均发挥重要作用,但目前利用树鼩开展DNA甲基化表观遗传机制方面的研究还较少,因此研究树鼩大脑的DNA甲基化模式有助于进一步理解表观调控在灵长类大脑进化中的作用,同时提高树鼩作为模式物种的实用性。
家犬(Canis lupus familiaris)作为最早驯化动物之一,在人类社会中扮演着重要角色。对家犬和犬科动物开展研究对遗传学、医学和生态学多领域发展深有裨益。2024年11月26日,张亚平学科组联合国家生物信息中心赵文明团队发布新一版犬科动物综合数据库iDog2.0(https://ngdc.cncb.ac.cn/idog/),实现了犬科动物多维组学数据整合,为国内外家犬研究学者提供了有...
羊草是我国北方草原的优良牧草,也是生态恢复的重要草种,对高光、干旱、寒冷等非生物胁迫具有良好的适应性。然而,受羊草遗传信息和转化技术限制,其适应性调控的分子机制尚不明确。迄今为止,用于羊草性状改良的优异基因资源仍然有限,影响了分子育种技术体系在羊草快速改良中的应用。
薄荷茎叶中富含精油,是一种用途广泛的芳香植物,也是重要的中药材。薄荷醇是薄荷精油的主要药效成分,其含量高低是决定薄荷油品质的关键。目前关于薄荷醇合成的调控机制研究鲜有报道。所(园)科研人员在薄荷中鉴定到一个bZIP家族ABFs亚家族转录因子编码基因McbZIP1,研究表明McbZIP1定位于细胞核中,具有转录激活活性。
2024年11月13日,中国农业科学院作物科学研究所作物生物信息学及应用创新团队与南京农业大学合作,在大豆中鉴定到一个调控大豆抗倒伏的关键基因 CS1 ,阐明了该基因通过调节生长素的定向运输调控大豆抗倒性的分子机制。相关研究成果在线发表在《植物生物技术(Plant Biotechnology Journal)》上。
水平基因转移介导的多样化过程是群落构建中重要的进化生态学动力,然而其是否介导了微生物对人类活动干扰的响应呢?依托内蒙古锡林浩特长期施氮和停止施氮实验平台,结合土壤养分和胁迫变化,研究团队在四象限框架下提出并证实了水平基因转移和分子网络层面的假说:1)环境选择驱动力的改变使得微生物通过水平基因转移提升群落适合度;2)资源匮乏和土壤酸化胁迫提升寡营养的胁迫耐受微生物类群间的合作。此外,氮添加导致细菌水...
哺乳动物精原干细胞是雄性生育力维持的细胞基础,也是制备生殖系基因编辑动物的细胞载体。实现人类精原干细胞的体外长期扩增培养,对患癌男童生育力的保存具重要意义。猴精原干细胞系的建立,有助于解决猴基因编辑中长片段精准插入难题。迄今,人和非人灵长类精原干细胞的体外长期扩增培养仍是领域难题。理解人和非人灵长类精原干细胞稳态调控机制,能够为体外培养条件的优化提供重要理论指导。尽管国际上已有几个工作分析了人和猴...
让番茄变甜的基因找到了(图)     番茄  变甜  基因  自然       2024/11/20
2024年11月14日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所、深圳农业基因组研究所及国内科研单位合作,鉴定到抑制番茄果实糖积累的刹车基因CDPK27/26,通过基因敲除可使番茄果实糖含量增加30%以上,且不影响番茄单果重和单株产量。相关研究成果发表在《自然(Nature)》上。
金针菇具有显著的营养价值和经济价值,但其驯化过程中遗传多样性的变化和基因组演化机制尚未得到充分研究。近日,中国科学院微生物研究所赵瑞琳研究团队在Journal of Advanced Research上发表题为“Pan-genome analysis reveals genomic variations during enoki mushroom domestication, with empha...
粗叶榕(Ficus hirta Vahl)又称五指毛桃,为桑科榕属的药食同源植物,是一种具有重要经济价值的植物。其根部为浅黄色,有香气,富含多种生物活性化合物,如黄酮类、苯丙素类和多糖等,这些成分在植物的抗病能力、适应环境变化以及药用价值上都扮演着关键角色。目前,对粗叶榕的基因组研究仍然相对较少,尤其是在其特定药用成分的生物合成途径方面。尽管已有部分关于粗叶榕基因组的初步研究报告,但这...
藏羚(Pantholops hodgsonii)是世居青藏高原的典型反刍动物,平均分布海拔3,250-5,500 m,属鲸偶蹄目(Cetartiodactyla),牛科(Bovidae),藏羚属(Pantholops),是藏羚属唯一物种。19世纪中期至20世纪初,猖獗的非法盗猎使藏羚的种群数量下降了约90%,2000年被IUCN红色濒危物种名录评估为濒危物种。经过30多年的保护,藏羚的种群数量恢复...
中国科学院海洋研究所发布了深海灰蝾螺高质量染色体水平基因组参考序列,基于比较基因组方法探索驱动深海灰蝾螺适应深海热液喷口的分子机制,成果2024年11月10日在学术期刊Science of The Total Environment正式发表。
基因编辑动物在生物科学和医学研究中发挥着重要作用,在农业领域展现出实际应用潜力。随着基因编辑技术的发展,基因编辑动物的数量快速增长。学界越来越关注基因编辑系统对生物基因组的影响以及基因编辑动物可能出现的新发突变问题。目前,关于基因编辑动物数据的整理、汇总及标准化分析相对缺乏,限制了研究人员挖掘和利用这些数据。

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