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搜索结果: 1-15 共查到3D-QSAR相关记录17条 . 查询时间(0.062 秒)
选取64个具有潜力的含磷嘧啶类细胞周期依赖性蛋白激酶(CDK9)小分子抑制剂,采用分子对接方法研究了该类小分子与CDK9的结合作用,结果表明,分子构象、氢键形成、疏水性和氨基酸残基Cys106在此类抑制剂与CDK9的结合过程中具有重要作用. 在配体叠合的基础上,运用比较分子力场分析(CoMFA)、比较分子相似性指数分析(CoMSIA)和Topomer CoMFA(T-COMFA)研究了分子结构与抑...
设计、合成高活性的小分子p53-MDM2结合抑制剂,建立具有预测能力的3D-QSAR模型。方法 采用分子模拟软件Sybyl,利用比较分子场方法(CoMFA)、比较分子相似性指数法(CoMSIA),选择已报道的具有p53-MDM2结合抑制活性的一类有相同母核的21个异喹啉酮衍生物作为训练集,7个作为预测集进行3D-QSAR模型的建立和验证。结果 模型具有较高q2(q2CoMFA=0.545,q2Co...
测定了16种酚衍生物对青海弧菌(Q67)的半致死浓度EC50(mol·L-1), 通过比较分子力场分析方法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析方法(CoMSIA), 对16种酚衍生物的毒性进行了三维定量结构-活性相关(3D-QSAR)研究, 建立了CoMFA和CoMSIA模型. 其中CoMFA模型交叉验证相关系数Q2 = 0.703, 非交叉验证相关系数R2 = 0.983, F检验值F = 1...
N-氨基咪唑(NAIMs)能通过三种不同的作用方式抑制HIV-1的复制. 用比较分子场(CoMFA)方法对一系列有共同骨架的NAIM分子建立3D-QSAR模型. 与以往模型不同的是,在偏最小二乘(PLS)分析中尝试引入分子轨道能量的信息来研究生物活性与分子轨道能量的关系. 结果得到了几个模型,分子轨道能量对模型的贡献能为21.7%,轨道HOMO5对模型的贡献最大.
细胞周期蛋白激酶(cyclin-dependent kinases, CDKs)是近年来治疗肿瘤的重要靶标. 由于大多数激酶ATP结合位点的保守性, CDK选择性激酶抑制剂的开发成为当前的研发难点和热点. 针对吲哚咔唑类CDK抑制剂, 我们采用比较分子力场分析方法(CoMFA)建立了CDK2-QSAR(quantitative structure-activity relationship)和CD...
GABAA受体是中枢神经系统内重要的抑制性受体,有广泛的神经生理活性.由于镇静/抗惊厥药物在临床上的广泛应用,使得其中苯并二氮杂作用位点尤为重要.我们用比较分子场法(CoMFA)对一系列咪唑苯并二氮杂类化合物(BZ)与五种重组受体亚型的亲和力进行了结构活性关系研究,得到的一组模型都有较高的交叉验证系数.并在此基础上,建立了非交叉验证的一组PLS模型.用该组模型对随机选择的6个化合物组成的测试集进行...
用比较分子力场分析 (CoMFA) 方法和比较分子相似性指数分析 (CoMSIA) 方法对所合成的新磺酰脲类化合物的除草活性进行了较为系统的3D-QSAR分析.两种方法所建立的模型对化合物的除草活性预测能力均较好,所得三维等值线图为合成高活性的化合物能提供指导作用.
为寻找用于治疗良性前列腺增生的新型α1受体拮抗剂, 以2-({4-[2-(2-氯苯氧基)乙基]哌嗪-1-基}甲基)-5-甲基苯并噁唑(wb5c)为先导物, 以5-氯-2-氨基酚和取代苯酚为原料, 经缩合、卤代、氨化、Williamson醚合成、取代等反应, 设计合成了8个新化合物, 其结构经ESI-MS, 1H NMR, IR及HRMS确证. 大鼠肛尾肌收缩功能实验表明, 目标化合物具有中等强度α...
用柔性分子对接方法(FlexX)将15个4,5,6-三取代嘧啶苯磺酰脲化合物以及3个不含5-位取代嘧啶苯磺酰脲化合物(分别为4,6-双取代嘧啶和4-取代嘧啶)和乙酰羟酸合成酶(AHAS)活性口袋进行了对接, 对接程序预测的抑制剂和酶之间的相互作用能与抑制活性之间有一定的相关性, 相关系数为0.660. 然后采用比较分子相似性指数分析(CoMSIA)对27个新型4,5,6-三取代嘧啶苯磺酰脲类化合物...
利用VolSurf参数和比较分子场分析(CoMFA)方法对N,N-二取代三氟-3-氨基-2-丙醇衍生物类胆固醇酯转运蛋白抑制剂进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)模型研究, 均得到较好的结果, 训练集模型具有良好的预测能力. VolSurf参数分析表明抑制活性高的分子必须具有合适的亲水性、多的氢键给体和少的氢键受体; 在一定范围内, 分子量大、表面光滑且非球性高的分子抑制活性高; 高疏水性以及...
苯并嗪酮衍生物是近年来发现的一类抗血小板聚集化合物, 在前人研究的基础上利用比较分子场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)对23个苯并嗪酮衍生物进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究. 其中CoMFA模型交叉验证系数Q2=0.703, 回归系数R2=0.994, 计算值与实验值的平均方差SEE=0.053, 统计方差比F=184.773; CoMSIA模型Q2=0.8...
摘要 通过比较分子力场分析方法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析方法 (CoMSIA),系统研究了30个2-烷基(烷硫基)-5-吡唑基-1,3,4-噁二唑(噻二?颉⑷颍├嗷衔镆种扑疚瓶莶【锘钚缘娜酆隙抗剐Ч叵怠6杂?CoMFA,研究了不同移动步长对考虑静电场和立体场作用时构效关系的影响;对于 CoMSIA,研究了移动步长、场的组合、衰减因子α等参数变化对构效关系的影响, 发现当考...
摘要 用比较分子场分析方法对5-(1-芳基-1,4-二氢-6-甲基-4-哒嗪酮-3-基)-2-芳基胺-1,3,4-噻二唑类化合物进行了三维定量构效关系研究,发现影响其抗菌活性主要为立体能和静电能,立体能与静电能分别为0.505和0.495。所得到的模型交叉验证rcv2=0.769,相关系数r2=0.939,F=60.996,s=0.074,表明模型具有较好的预测能力。此研究结果与2D-QSAR的结...
摘要 用CoMFA方法对一组含氟农药分子的抗小麦赤霉病活性进行了定量构效关系研究。发现影响药效的立体场与静电场的贡献分别为90.3%和9.7%,立体场的影响是占主导性的。该模型非交叉验证的相关系数(r^2)为0.991,F值是297.524,标准偏差(S)为0.015,表明模型具有较好的预测能力。根据该模型,设计并预测了几个新的化合物,其活性都在0.96以上。经过研究表明在预测结构的某些位置添加位...
对一组抑制肥大细胞脱颗粒的异喹啉类化合物的活性及毒性进行了3D-QSAR研究,采用距离比较法(DISCO)得到了它们的药效团模型,通过选择不同的叠合方式,建立了相关性很好的比较分子力场分析(CoMFA)模型,其交叉验证参数R^2~cv分别为0.654和0.662,非交叉验证的相关系数分别为0.990与0.983,通过查阅统计量F表,表明活性及毒性模型的置信度都大于99%,显示模型具有较强的预测能力...

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