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运用高通量转录组测序技术分析华重楼种子萌发前后激素信号转导途径和合成通路中的差异表达基因，旨在初步揭示 GA3和 IAA 组合处理华重楼种子萌发的调控机理。结果表明：600 mg · L-1 GA3 + 40 mg · L-1 IAA 可使华重楼种子萌发率在 8 个月时达到 87.33%。结合转录组测序结果，将差异表达基因与KEGG 数据进行比较发现：外源施加 GA3 和 IAA 可使 GA 分解...
香蕉Aux/IAA基因家族的全基因组鉴定及表达分析
香蕉 Aux/IAA基因家族 生物信息学 基因表达
2019/11/5
对香蕉Aux/IAA基因家族进行了全基因组鉴定，获得分布于除1号染色体外的10条染色体上的44个家族成员，其CDS长度为378 ~ 1 062 bp，其中10个存在选择性剪切体。它们编码的蛋白包含125 ~ 353个氨基酸，均为不含信号肽的亲水蛋白。序列分析结果表明：该基因家族成员多为5个外显子和4个内含子的基因结构，编码蛋白多具有4个典型的保守基序。亚细胞定位预测结果显示，Aux/IAA成员多定...
桃果实中miR160a与其靶基因ARF的鉴定及对IAA的响应分析
桃 Ppe-miR160a 靶基因 ARF 生长素
2019/6/5
以水蜜桃品种‘小白凤’果实为试材，利用miR-RACE技术验证了桃miR160a的精确序列，克隆了其3个ARF靶基因（PpARF18、PpARF17和PpARF18-like）的ORF序列。利用RLM-RACE技术以及qRT-PCR方法对Ppe-miR160a作用于3个靶基因的模式及频度进行了分析。结果表明，Ppe-miR160a的精确序列与预测序列在5′端和3′端均存在1个碱基的差异，其3个靶基...
桃Aux/IAA家族基因鉴定及在果实成熟过程中的表达分析
桃 生长素/吲哚乙酸基因 果实成熟 生长素
2018/4/9
通过生物信息学鉴定桃基因组中生长素/吲哚乙酸（Aux/IAA）基因家族，并对其在溶质型和硬质型桃果实成熟阶段的表达水平进行qRT-PCR检测。结果表明：桃Aux/IAA基因家族包含22个成员，这些基因集中分布在5条染色体上，以第1条染色体上含有最多，为8个。大部分Aux/IAA基因包含高度保守的Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ功能域，聚类分析表明其分为10类。基因结构分析显示这些基因包含2 ~ 5个外显子。荧光定量...