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前沿|南京农业大学农学院张文利课题组解析了水稻R- loop应答冷胁迫分子机制（图）
R-loop 水稻 应答冷胁迫 分子机制
2023/11/29
近日，南京农业大学张文利教授课题组在New Phytologist在线发表了题为“R‐loops act as regulatory switches modulating transcription of COLD‐responsive genes in rice”的研究论文。研究揭示了R-loop在水稻应答冷胁迫中的分子机制，一方面有助于从DNA二级结构层面理解水稻或其它作物响应冷胁迫的分子机...
The OsNAC23-Tre6P-SnRK1a feed-forward loop regulates sugar homeostasis and grain yield in rice
Tre6P phosphatase trehalose OsNAC23
2023/3/9
Tre6P (trehalose-6-phosphate) mediates sensing of carbon availability to maintain sugar homeostasis in plants, which underpins crop yield and resilience. However, how Tre6P responds to fluctuations in...
黄鳍棘鲷线粒体D-LOOP序列的遗传结构
黄鳍棘鲷 D-loop序列 遗传多样性 遗传分化
2020/12/18
为探明分布于我国华南沿海黄鳍棘鲷群体遗传多样性与遗传分化状况，本研究采用线粒体控制区(D-loop)基因序列分析华南沿海的厦门、汕尾、阳江、海口、三亚、北海、钦州和防城8个地理位置的黄鳍棘鲷群体的遗传多样性及群体遗传结构。结果显示，8个黄鳍棘鲷群体320条D-loop序列全长为947~958 bp。共检测到29个插入或缺失位点和210个变异位点，其中简约信息位点142个，单一变异位点68个；总体的...
Maternal Origin of Turkish and Iranian Native Chickens Inferred from Mitochondrial DNA D-loop Sequences
Iranian Native Chicken Breeds mtDNA D-loop Haplogroup Maternal Origin
2016/11/10
To assess genetic diversity and maternal origin of Turkish and Iranian native chicken breeds, we analyzed the mtDNA D-loop sequences of 222 chickens from 2 Turkish (Denizli and Gerze) and 7 Iranian (W...
鸡mtDNA D-loop区单倍型簇频率与中国家鸡多母系起源研究
家鸡 mtDNA D-loop区 单倍型 聚类分析 频率 起源
2016/12/26
本研究旨在通过分析家鸡和原鸡D-loop区单倍型簇的区域性分布和频率揭示中国家鸡多母系起源的区域和传播途径。通过对1 347条鸡D-loop序列进行完全对比排序，共发现198种单倍型，聚成12个单倍型簇。分析结果显示，海岛型红色原鸡与家鸡和大陆型红色原鸡有明显差异；苏门答腊大陆型红色原鸡作为独立分支，也体现出与东南亚大陆型红色原鸡的区别。单倍型簇频率分析显示，Clade C代表的母系可能更早在东南...
Mitochondrial D-loop sequence variation among Hucul horse
genetic diversity horse mitochondrial DNA phylogeny
2015/6/24
Genetic variation in the Czech Hucul horse population was analyzed using a sequence analysis of the D-loop region of mitochondrial DNA. One hundred and sixty-five Hucul horses were tested. Sequencing ...
为评价现有选育方式下的遗传结构现状及选育潜力，采用mtDNA D-loop序列差异分析技术，对埃及品系尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）的3个选育世代群体共80尾鱼开展世代间遗传结构变异分析。结果显示：1）3个世代群体中个体序列长度为552~555 bp，包括52个变异位点、12个单倍型，平均单倍型多样度（H）为0.569；2）3个世代群体的核苷酸多态性（Pi）分别为0.02...
文章对内蒙古达里湖和岗更湖东北雅罗鱼（Leuciscus waleckii Dybowski）的mtDNA D-loop 序列进行扩增，获得了896 bp的同源基因序列，得到的同源基因片段中A、T、C和G碱基的平均含量，达里湖群体为 32.0%、32.2%、21.3%和14.5%；岗更湖群体为32.0%、32.2%、21.4%和14.5%；达里湖和岗更湖鱼群D-loop基因CG含量相当，未见明显差...
采用PCR扩增和DNA测序技术，测定分析了大菱鲆引自冰岛和法国的2个引进群体以及1个国内累代繁养群体共60尾个体的mtDNA D-loop区部分序列的遗传多样性。结果表明，60尾个体中，扩增获得的mtDNA D-Loop区部分序列长度为739～759bp；共检测到46个变异位点，其中单一变异位点17个，简约信息位点29个；共检测出56个单倍型，各群体的单倍型多样度分别为冰岛1.000、法国0.95...
为研究安徽江淮水牛群体的分子种质特性，本试验测定了江淮水牛2个亚群共82个个体的线粒体Dloop区和细胞色素b基因完整序列，分析了序列遗传多态性及系统进化关系，并结合GenBank中已发表的141条中国水牛Dloop序列，进行了联合分析。结果在Dloop区内共发现核苷酸多态位点91个，组成104个单倍型，其中32个是在江淮水牛中新发现的单倍型。总体mtDNA Dloop区核苷酸多样性为(0...
为研究安徽江淮水牛群体的分子种质特性，本试验测定了江淮水牛2个亚群共82个个体的线粒体Dloop区和细胞色素b基因完整序列，分析了序列遗传多态性及系统进化关系，并结合GenBank中已发表的141条中国水牛Dloop序列，进行了联合分析。结果在Dloop区内共发现核苷酸多态位点91个，组成104个单倍型，其中32个是在江淮水牛中新发现的单倍型。总体mtDNA Dloop区核苷酸多样性为(0...
家鸭、媒鸭和野鸭mtDNA D-loop区的遗传变异
鸭 D-loop 遗传多样性 系统进化
2013/12/3
旨在从mtDNA水平探讨我国家鸭的遗传多样性及家鸭与野鸭间的亲缘关系。运用DNA测序方法，测定了不同地域、水域和表型性状的9种家鸭（北京鸭、高邮鸭、巢湖鸭、绍兴鸭、连城白鸭、吉安红毛鸭、文登黑鸭、云南麻鸭、建昌鸭）80个个体、4 种媒鸭（西湖野鸭、钱江野鸭、枞阳媒鸭、媒头鸭）26个个体和斑嘴鸭8个个体，共计114个个体的mtDNA Dloop区 667 bp序列。9种家鸭单倍型多样度和核苷酸多样...
Multiple Maternal Lineages of Vietnamese Local Chickens Inferred by Mitochondrial DNA D-loop Sequences
Mitochondrial DNA Vietnamese Local Chickens Maternal Lineages
2016/5/6
In this study, mitochondrial DNA (mtDNA) sequence polymorphism was used to assess genetic diversity of nine Vietnamese local chicken breeds. In addition, two Chinese breeds kept in Vietnam were includ...
采用PCR技术对12条绵阳市野生黄鳝mtDNA D-loop区部分序列进行扩增和测序，对所得9个个体606 bp的核甘酸片段序列进行遗传变异和系统进化分析：9条野生黄鳝D-loop序列的四种核苷酸组成中，T和C的组成频率为固定值，而A和G的频率有一定的差异；A+T的平均组成频率(57%)显著高于C+G的频率(43%)。从9条D-loop序列中一共检测到了5个多态位点，占总核苷酸序列总数(606 b...
云南文山黄牛mtDNA D-loop区遗传多样性分析
云南文山 黄牛 mtDNA D-loop区 遗传多样性
2009/10/21
云南文山黄牛mtDNA D-loop区遗传多样性分析。