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华中农业大学发现MAGIC群体具有强大QTL定位和优异等位基因挖掘功能（图）
基因 分析 遗传
2024/10/27
植物遗传研究的重要优势是遗传群体构建的便利。传统上用于遗传作图的主要有基于连锁分析的双亲群体和基于关联分析的自然群体和多亲群体。但由于双亲群体的遗传背景狭窄，可定位的 QTL 有限，自然群体存在群体结构和低频变异等缺陷，多亲群体的关联分析检测功效低等原因，很难在单个群体中定位多个真实准确的QTL。
本发明属于生物技术领域，公开了中棉所70群体中与棉花纤维强度相关的一个QTL，位于陆地棉24号染色体，定位到6个SNP分子标记，定位到116个基因并对其中一些基因的表达模式进行了分析。本发明还公开了一种与棉花相关的QTL的应用，该QTL和SNP分子标记可用于分子标记辅助选择育种，显著提高强度纤维品系的选择效率，为进一步提高纤维品质提供了一种最经济有效的分子育种新途径。
本发明公开了一种检测中麦895旗叶夹角QTL的CAPS标记及应用。本发明2016～2017年度对杨麦16/中麦895DH群体174份家系旗叶夹角进行了田间鉴定，用660K SNP芯片对该群体进行了基因型分析，构建了高密度连锁图谱，QTL定位发现位于1Ds上控制旗叶夹角的主效位点，LOD值为3.4～10.8，解释表型变异(PVE)6.1％～9.1％，该位点记为QFla.caas-1Ds。基于其连锁标...
本发明公开了陆地棉纤维伸长率相关的单体型中D01上SNP分子标记及其应用，所述分子标记如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.46之一所示；其导致纤维伸长率出现多态性。本发明提供的与陆地棉纤维伸长率相关的SNP分子标记可以用于棉花纤维伸长率性状的早期预测和筛选，还可以用于棉纤维伸长率分子标记辅助育种。本方法主要通过直接检测DNA，在棉花的各个组织、各个发育阶段均可应用，不受季节、环境限制、不...
本发明公开了与陆地棉D08染色体纤维强度相关主效QTL紧密连锁的SNP位点及应用，该陆地棉纤维强度主效QTL位点qFS D08 1、qFS D08 2和qFS D08 3均位于染色体D08上，LOD值在10.299和13.774之间，可解释13.917％ 17.148％的表型变异。本发明所述的SNP分子标记是以陆地棉稳定的RIL群体为材料，通过简化基因组测序(GBS)的方法得到。本发明所公开的这些...
本发明涉及一种棕色棉纤维色泽主效QTL连锁的SSR分子标记及用途，属于植物分子遗传学和彩色棉种质技术领域，本发明所提供的棕色纤维色泽主效QTL的分子标记的两个引物，标记NAU5235和标记NAU3496进行PCR扩增，检测扩增产物中有270bp片段和310bp片段。通过已知的染色体进行锚定，将主效QTL位点定位在第15号染色体上。同时，本发明的两个分子标记皆可用于检测其纤维色泽或者其后代的纤维色泽...
中国林业科学研究院热林所在速生桉QTL定位研究中取得进展（图）
QTL定位 材林树种 分子遗传
2023/3/19
木材资源短缺已经成为国际社会公认的发展障碍问题之一，我国森林覆盖率低于全球平均水平，可利用木材资源少。桉树(Eucalyptus)是我国重要的人工林用材树种，尾叶桉(E. urophylla)、细叶桉(E. tereticornis)及其杂交种是华南地区重要的短周期用材林树种(尤其是用于纸浆工业用材林营建)，也是较好的林木分子遗传研究材料。高密度遗传图谱构建及重要经济性状(生长与材性)的QTL定位...
2021年9月28日，Nature Communications在线发表了华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室水稻团队、湖北洪山实验室李一博教授课题研究成果。该研究开发了一种快速、高通量克隆数量性状位点（QTL）基因的新方法——RapMap（图1），发现了单位点遗传的本质判断标准，快速克隆了8个水稻种子大小QTL基因，并揭示了籼稻细长粒形是在水稻长期驯化和改良进程中定向选择的结果。
根系是植物吸收土壤中水分和矿质营养的重要器官, 影响植物的整体生长发育。侧根是植物根系构型的重要因素。植物光合作用产物——糖在侧根原基(LRP)的起始、形成以及伸长阶段发挥了关键作用。本研究发现拟南芥(Arabidopsis thaliana)生态型Bayreuth (Bay-0)和Shahdara (Sha)在侧根发育对葡萄糖的响应中存在显著差异, 利用Bay-0×Sha重组自交系(RIL)群体...
玉米穗粗性状的全基因组关联分析及QTL元分析
玉米 穗粗 全基因组关联分析 元分析
2018/12/4
玉米(Zea mays)是全世界总产量最高的粮食作物, 穗粗是玉米单株产量的重要指标。利用FarmCPU软件对292份玉米自交系进行全基因组关联分析(GWAS), 筛选到28个显著性单核苷酸多态性(SNP)位点。借助IBM2 2008 Neighbors高密度图谱整合了2007~2015年文献发表的105个玉米穗粗性状的数量性状基因座(QTL), 采用元分析的方法, 确定了10个与穗粗相关的“一致...
Salinity Tolerance and Na Exclusion in Wheat: Variability, Genetics, Mapping Populations and QTL Analysis
genetics mapping populations Na + exclusion QTL analysis salinity tolerance variability
2014/2/25
A wide range of variability in both Naexclusion and salinity tolerance was shown in Triticum dicoccoides and the best performing genotype, from Getit, was identified for further study andfor crossing....
以我国高产籼稻特青和美国优质粳稻Lemont为亲本培育的双向回交导入系为材料,采用单核苷酸多态性标记定位源相关性状(剑叶长、剑叶宽、剑叶面积、叶干重和比叶重)和库相关性状(穗总粒数、千粒重和穗实粒重)的QTL。特青剑叶长、穗总粒数和穗实粒重显著大于Lemont,剑叶宽则显著小于Lemont。双向导入系群体检测到影响源、库相关性状的QTL 62个,平均每个QTL解释群体表型变异的9.0%,变幅为3....
Evaluation of BTA1 and BTA5 QTL Regions for Growth and Carcass Traits in American and Korean Cattle
Quantitative Trait Loci Microsatellite Markers SNPs Carcass Traits
2016/5/10
Previously identified QTL regions on BTA1 and BTA5 were investigated to validate the QTL regions and to identify candidate genes for growth and carcass traits in commercial cattle populations from the...
Identification of Candidate Genes Associated with Beef Marbling Using QTL and Pathway Analysis in Hanwoo (Korean Cattle)
Hanwoo Marbling QTL Fine Mapping
2016/5/9
Marbling from intramuscular fat is an important trait of meat quality and has an economic benefit for the beef industry. Quantitative trait loci (QTL) fine mapping was performed to identify the marbli...